Caracterización fenotípica y genotípica de carbapenemasas de bacilos Gram negativos aislados en aspirados bronquiales en un hospital público de Santa Elena en tiempos de COVID-19
Resumen
Durante la pandemia de COVID-19 se ha documentado la emergencia de microorganismos extremadamente resistentes a los antibióticos, destacando los organismos productores de carbapenemasas, que confieren resistencia a los carbapenémicos y otros antimicrobianos. Este trabajo tuvo como objetivo caracterizar, fenotípica y genotípicamente, las carbapenemasas (bla KPC, bla VIM, bla IMP-1, bla NDM y bla OXA-48) producidas por aislamientos clínicos de bacilos Gram negativos aislados en aspirados bronquiales de pacientes recluidos en la unidad de cuidados intensivos de un hospital público de Santa Elena (Ecuador), durante un período de dos años (abril 2020 - abril 2022). En este periodo, se detectaron, principalmente, cepas pertenecientes al Complejo A. baumannii (41,41%; n=41), K. pneumoniae (21,21%; n=21) y P. aeruginosa (4,04%; n=4). En 13 cepas de K. pneumoniae se encontró el gen bla KPC (61,90%), en 3 bla NDM (14,29%) y en 1 bla VIM (4,76%). En los aislamientos del Complejo A. baumannii se detectaron los genes bla IMP-1 (2,44%) y bla NDM (2,44%). En un aislado de P. aeruginosa se identificó e1 gen bla VIM (50,00%). La identificación rápida y precisa de carbapenemasas proporciona información epidemiológica relevante para la terapia antimicrobiana, el control de infecciones y para la prevención de una diseminación generalizada.
Citas
Melgarejo-Touchet N, Brítez CM, Busignani S, Falcón M, López E, Laconich M, et al. Caracterización molecular de carbapenemasas en bacilos gramnegativos circulantes en hospitales de Paraguay. Primer cuatrimestre 2021. Memorias del Inst Investig en Ciencias la Salud [Internet]. 2021;19(2):49-58. Disponible en: https://revistascientificas.una.py/index.php/RIIC/article/view/1948 DOI: 10.18004/mem.iics/1812-9528/2021.019.02.49.
Requena Sarcolira D, Vásquez Cortéz Y, Gil Torres A, Cedeño Prado J, Chabín Jouayed M, Delgado Rodríguez E, et al. Detección fenotípica y genotípica de la producción de carbapenemasas tipo NDM-1 y KPC en enterobacterias aisladas en un laboratorio clínico en Maracay, Venezuela. Rev Chil Infectología [Internet]. 2021;38(2). Disponible en: https://www.revinf.cl/index.php/revinf/article/view/815 DOI: 10.4067/S0716-10182021000200197.
Gritti MA, Melo Favalesso M, Gómez Capará LG, Elisa Peichoto M. Resistencia a Antibióticos De Relevancia Clínica En Un Hospital De Corrientes. Rev Medica del Hosp Corrientes [Internet]. 2021;81(6):946-53. Disponible en: https://www.medicinabuenosaires.com/PMID/34875592.pdf PMID 34875592.
Ambler RP. The structure of β-lactamases. Philos Trans R Soc London B [Internet]. 1997;289(1036):321-31. Disponible en: https://doi.org/10.1098/rstb.1980.0049 DOI: 10.1098/rstb.1980.0049 PMID 6109327.
Fernández P, Moreno L, Yagüe G, Andreu E, Jara R, Segovia M. Colonization by multidrug-resistant microorganisms in ICU patients during the COVID-19 pandemic. Med Intensiva [Internet]. 2021;45(5):313-5. Disponible en: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2173572721000436 DOI: 10.1016/j.medine.2021.04.006 PMID 34059221 PMCID PMC8086975.
OPS/OMS. El impacto de la COVID-19 en la resistencia antimicrobiana - OPS/OMS | Organización Panamericana de la Salud [Internet]. 2021. Disponible en: https://www.paho.org/es/noticias/17-11-2021-impacto-covid-19-resistencia-antimicrobiana.
Cataño-Correa JC, Cardona-Arias JA, Porras Mancilla JP, García MT. Bacterial superinfection in adults with COVID-19 hospitalized in two clinics in Medellín-Colombia, 2020. PLoS One [Internet]. 2021;16(7):e0254671. Disponible en: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0254671 DOI: 10.1371/journal.pone.0254671 PMID 34255801 PMCID PMC8277025.
Loyola-Cruz MÁ, Gonzalez-Avila LU, Martínez-Trejo A, Saldaña-Padilla A, Hernández-Cortez C, Bello-López JM, et al. ESKAPE and Beyond: The Burden of Coinfections in the COVID-19 Pandemic. Pathogens [Internet]. 2023;12(5). Disponible en: https://www.mdpi.com/2076-0817/12/5/743 DOI: 10.3390/pathogens12050743 PMID 37242413 PMCID PMC10222376.
Romero Thomas G, Corso A, Pasterán F, Shal J, Sosa A, Pillonetto M, et al. Increased Detection of Carbapenemase-Producing Enterobacterales Bacteria in Latin America and the Caribbean during the COVID-19 Pandemic. Emerg Infect Dis J [Internet]. 2022;28(11):1. Disponible en: https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/28/11/22-0415_article DOI: 10.3201/eid2811.220415 PMID 36286547 PMCID PMC9622262.
Organización Panamericana de la Salud/Organización Mundial de la Salud. Alerta Epidemiológica: Emergencia e incremento de nuevas combinaciones de carbapenemasas en Enterobacterales en Latinoamérica y el Caribe [Internet]. 2021. Disponible en: https://reliefweb.int/report/world/alerta-epidemiol-gica-emergencia-e-incremento-de-nuevas-combinaciones-de-carbapenemasas.
Teerawattanapong N, Kengkla K, Dilokthornsakul P, Saokaew S, Apisarnthanarak A, Chaiyakunapruk N. Prevention and Control of Multidrug-Resistant Gram-Negative Bacteria in Adult Intensive Care Units: A Systematic Review and Network Meta-analysis. Clin Infect Dis [Internet]. 2017;64(suppl_2):S51-60. Disponible en: https://doi.org/10.1093/cid/cix112 DOI: 10.1093/cid/cix112 PMID 28475791.
Croxatto A, Coste AT, Pillonel T, Bertelli C, Greub G, Prod’hom G. Evaluation of the BD Phoenix™ CPO Detect Test for the detection of carbapenemase producers. Clin Microbiol Infect [Internet]. 2020;26(5):644.e9-644.e15. Disponible en: https://doi.org/10.1016/j.cmi.2019.10.002 DOI: 10.1016/j.cmi.2019.10.002 PMID 31634549.
Murata M, Kosai K, Akamatsu N, Matsuyama Y, Oda M, Wakamatsu A, et al. Diagnostic Performance of BD Phoenix CPO Detect Panels for Detection and Classification of Carbapenemase-Producing Gram-Negative Bacteria. Microbiol Spectr [Internet]. 2023;11(3):e0089723. Disponible en: https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.00897-23?url_ver=Z39.88-2003&rfr_id=ori:rid:crossref.org&rfr_dat=cr_pub%20%200pubmed. DOI: 10.1128/spectrum.00897-23 PMID 37162344 PMCID PMC10269800.
Cointe A, Walewski V, Hobson CA, Doit C, Bidet P, Dortet L, et al. Rapid carbapenemase detection with Xpert Carba-R V2 directly on positive blood vials. Infect Drug Resist [Internet]. 2019;12:3311-6. Disponible en: https://www.dovepress.com/rapid-carbapenemase-detection-with-xpert-carba-r-v2-directly-on-positi-peer-reviewed-fulltext-article-IDR. DOI: 10.2147/IDR.S204436 PMID 31695450 PMCID PMC6815938.
Organización Mundial de la Salud. Programas De Optimización De Los Antimicrobianos En Instituciones Sanitarias De Los Paises De Ingresos Bajos Y Medianos. Manual Práctico De La OMS. [Internet]. Organización Mundial de la Salud. 2020. 1-88 p. Disponible en: https://iris.who.int/handle/10665/335947.
Servicio Antimicrobianos. INEI-ANLIS «Dr. Carlos Malbran». Algoritmos de detección de Carbapenemasas 2021 [Internet]. 2021. Disponible en: https://antimicrobianos.com.ar/2021/11/algoritmos-de-deteccion-de-carbapenemasas-2021/.
Jonas D, Reuter S, Klassen S, Weber S, Buck M, Giani T, et al. Evaluation of the BD Phoenix CPO detect panel for prediction of Ambler class carbapenemases. Sci Rep [Internet]. 2021;11(1):13150. Disponible en: https://doi.org/10.1038/s41598-021-92336-3 DOI: 10.1038/s41598-021-92336-3 PMID 34162904 PMCID PMC8222379
CLSI. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing. 33 rd. Edition. CLSI Supplement M100. Clinical and Laboratory Standards Institute. 2023
Cepheid. Xpert® Carba-R [Internet]. 2020. Disponible en: https://web-support.cepheid.com/Package Insert Files/Xpert-Carba-R-Rx-Only-US-IVD-ENGLISH-Package-Insert-301-2438-Rev-G.pdf
World Medical Association. World Medical Association Declaration of Helsinki: Ethical Principles for Medical Research Involving Human Subjects. JAMA [Internet]. 2013;310(20):2191-4. Disponible en: https://doi.org/10.1001/jama.2013.281053 DOI: 10.1001/jama.2013.281053 PMID 24141714
Software de base de datos de laboratorio de microbiología WHONET [Internet]. 2025. Disponible en: https://whonet.org/
Buehler PK, Zinkernagel AS, Hofmaenner DA, Wendel Garcia PD, Acevedo CT, Gómez-Mejia A, et al. Bacterial pulmonary superinfections are associated with longer duration of ventilation in critically ill COVID-19 patients. Cell Reports Med [Internet]. 2021;2(4):100229. Disponible en: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2666379121000458 DOI: 10.1016/j.xcrm.2021 PMID 33748789 PMCID PMC7955928
Gu D, Yan Z, Cai C, Li J, Zhang Y, Wu Y, et al. Comparison of the NG-Test Carba 5, Colloidal Gold Immunoassay (CGI) Test, and Xpert Carba-R for the Rapid Detection of Carbapenemases in Carbapenemase-Producing Organisms. Antibiotics [Internet]. 2023;12(2):300. Disponible en: https://www.mdpi.com/2079-6382/12/2/300 DOI: 10.3390/antibiotics12020300 PMID 36830211 PMCID PMC9952068
Cho H, Kim JO, Choi JE, Lee H, Heo W, Cha YJ, et al. Performance evaluation of automated BD Phoenix NMIC-500 panel for carbapenemase detection in carbapenem-resistant and carbapenem-susceptible Enterobacterales. J Microbiol Methods [Internet]. 2020;177:106042. Disponible en: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0167701220307582 DOI: 10.1016/j.mimet.2020.106042 PMID 32890572
WHO. WHO Publishes List of Bacteria for Which New Antibiotics Are Urgently Needed [Internet]. 2017. Disponible en: https://www.who.int/news/item/27-02-2017-who-publishes-list-of-bacteria-for-which-new-antibiotics-are-urgently-needed
Remolina G SA, Conde M CE, Escobar C JC, Leal C AL, Bravo O JS, Saavedra R SY, et al. Tipos de carbapenemasas expresadas en Klebsiella spp., y Pseudomonas aeruginosa resistente a carbapenémicos en seis hospitales de alta complejidad de la Ciudad de Bogotá-Colombia. Rev Chilena Infectol. 2021;38(5):720-3. Disponible en: https://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0716-10182021000500720&lng=en&nrm=iso&tlng=en DOI: 10.4067/s0716-10182021000500720 PMID 035506842
Ferrer R, Soriano A, Cantón R, Del Pozo JL, García-Vidal C, Garnacho-Montero J, et al. A systematic literature review and expert consensus on risk factors associated to infection progression in adult patients with respiratory tract or rectal colonisation by carbapenem-resistant Gram-negative bacteria. Rev Esp Quimioter [Internet]. 2022;35(5):455-67. Disponible en: https://seq.es/abstract/rev-esp-quimioter-2022-july-21-2/ DOI: 10.37201/req/062.2022 PMID 35859521 PMCID PMC9548064
Garnacho-Montero J, Amaya-Villar R. The problem of multi-resistance in gram-negative bacilli in intensive care units: Treatment and prevention strategies. Med Intensiva [Internet]. 2022;46(6):326-35. Disponible en: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2173572722000790 DOI: 10.1016/j.medine.2022.04.006 PMID 35545496
Berneking L, Both A, Berinson B, Hoffmann A, Lütgehetmann M, Aepfelbacher M, et al. Performance of the BD Phoenix CPO detect assay for detection and classification of carbapenemase-producing organisms. Eur J Clin Microbiol Infect Dis [Internet]. 2021;40(5):979-85. Disponible en: https://doi.org/10.1007/s10096-020-04094-1 DOI: 10.1007/s10096-020-04094-1 PMID 33245470 PMCID PMC8084821
Rangel K, Chagas TP, De-Simone SG. Acinetobacter baumannii Infections in Times of COVID-19 Pandemic. Pathogens [Internet]. 2021;10(8):1006. Disponible en: https://www.mdpi.com/2076-0817/10/8/1006 DOI: 10.3390/pathogens10081006 PMID 34451470 PMCID PMC8399974
Vanegas JM, Higuita LF, Vargas CA, Cienfuegos AV, Rodríguez ÉA, Roncancio GE, et al. Acinetobacter baumannii resistente a carbapenémicos causante de osteomielitis e infecciones de la piel y los tejidos blandos en hospitales de Medellín, Colombia. Biomedica [Internet]. 2015;35(4):522-30. Disponible en: https://revistabiomedica.org/index.php/biomedica/article/view/2572 DOI: 10.7705/biomedica.v35i4.2572 PMID 26844441
Shahin M, Ahmadi A. Molecular characterization of NDM-1-producing Pseudomonas aeruginosa isolates from hospitalized patients in Iran. Ann Clin Microbiol Antimicrob [Internet]. 2021;20(1):76. Disponible en: https://doi.org/10.1186/s12941-021-00482-3 DOI: 10.1186/s12941-021-00482-3 PMID 34732199 PMCID PMC8567709
Pan American Health Organization. Florida International University. Recommendations for Implementing Antimicrobial Stewardship Programs in Latin America and the Caribbean: Manual for Public Health Decision-Makers. Washington, D.C.:PAHO, FIU; 2018. Pp 144
Reyes J, Komarow L, Chen L, Ge L, Hanson BM, Cober E, et al. Global epidemiology and clinical outcomes of carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa and associated carbapenemases (POP): a prospective cohort study. The Lancet Microbe [Internet]. 2023;4(3):e159-70. Disponible en: https://doi.org/10.1016/S2666-5247(22)00329-9 DOI: 10.1016/S2666-5247(22)00329-9 PMID 36774938 PMCID PMC10016089
Radhika A, Lakshmi JT, Ariyanachi K, Sakthivadivel V. Detection of Metallo Beta-Lactamase (MBL) Producing Pseudomonas aeruginosa in a Tertiary Care Hospital, Ghanpur, Medchal, India. Maedica (Buchar) [Internet]. 2022;17(1):134-42. Disponible en: https://www.maedica.ro/articles/2022/1/2022_17(20)_No1_pg134-142.pdf DOI: 10.26574/maedica.2022.17.1.134 PMID 35733755 PMCID PMC9168566
Derechos de autor 2025 Patricia Del Pilar Suarez Gonzalez, Carmen Obdulia Lascano-Espinoza, Carlos Jarrin-Beltrán, Adonis Faustino Hernández Ortiz, Gino Arturo Borbor Paltín
Esta obra está bajo licencia internacional Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-CompartirIgual 4.0.
La revista Kasmera se encuentra registrada bajo la licencia Creative Commons Reconocimiento 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0), disponible en: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/deed.es; lo que garantiza la libertad de compartir-copiar y redistribuir el material en cualquier medio o formato y adaptar-remezclar, transformar y construir a partir del material, siempre que se reconozca el nombre de los autores, del Departamento de Enfermedades Infecciosas y Tropicales de la Universidad del Zulia y la revista Kasmera, también se debe proporcionar un enlace a la obra original e indicar si se han realizado cambios.
El Departamento de Enfermedades Infecciosas y Tropicales de la Universidad del Zulia y la revista Kasmera no retiene los derechos sobre las obras publicadas y los contenidos son responsabilidad exclusiva de los autores, quienes conservan sus derechos morales, intelectuales, de privacidad y publicidad. El aval sobre la intervención de la obra (revisión, corrección de estilo, traducción, diagramación) y su posterior divulgación se otorga mediante una licencia de uso y no a través de una cesión de derechos, lo que representa que la revista Kasmera y el Departamento de Enfermedades Infecciosas de la Universidad del Zulia se eximen de cualquier responsabilidad que se pueda derivar de una mala práctica ética por parte de los autores.
Kasmera se considera una revista SHERPA/RoMEO color verde, es decir que permite el autoarchivo tanto del pre-print (borrador de un trabajo) como del post-print (la versión corregida y revisada por pares) y hasta de la versión final (maquetada tal como saldrá publicada en la revista) tanto en repositorios personales como en institucionales y bases de datos.
_pequeño1.png)
_pequeña.png)
_pequeña.png)
_pequeña.jpg)
